14 февраля 2001 г. в 6 часов утра российские военнослужащие схватили Магомеда Докуева и его отца Вахида Докуева в их доме в селе Новые Атаги. Вахид Докуев на следующий день был освобождён, но Магомед Докуев исчез. Бывший задержанный позже сообщил семье, что Магомед погиб в заключении и был похоронен на одной из российских военных баз, но семье не был разрешён доступ на предполагаемое место захоронения. В феврале 2003 года сотрудники «Правовой инициативы по России» и Максим Ферштман, адвокат датской юридической фирмы Böhler, Franken, Koppe, Wijngaarden Advocaten подали в Европейский суд жалобу по этому делу.